1960 yılında Seattle'da doğan Thayil, Chicago'nun Park Forest banliyösünde büyüdü. Ailesi Hindistan'ın Kerala eyaletinden Seattle'a geldi. Babası Boniface Thayil kimya mühendisliği diploması aldı, Chicago'da iş buldu ve ailesiyle birlikte oraya taşındı. Thayil 12 yaşında şarkı sözü yazmaya başladı.